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《宋史》中写到及至南宋庆元五年八月，“太室西北夹室楹生白芝四叶，前史以白芝为丧祥”，似乎像被命运安排好一样“明年八月，国连有大丧”。灵芝在早期文献记载中的明确考证第1个是从《神农本草经》考证。《神农本草经》是中国现存部完整的药物学著作，它集合了很多医学著作，创作于公元前，总结了汉代以前的所有的药物学知识。第2个是《神农本草经》中将灵芝分为上、中、下三种，《神农本草经》中记载的上品灵芝多达120种，长时间服用能够使身体轻盈，血气充足，进而达到，而中品也有120种，能够治疗疾病，补气养血。下品有125种，能够去除寒气，疏络筋脉，可以作为辅药。总计记载的灵芝有365种。其中上品的灵芝中有不少学名：赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝。《神农本草经》中还对上述的6种灵芝进行了详细描述。与当代的各类医学著作进行比较，我们可以清楚地发现，《神农本草经》对灵芝的药物性质、主要治疗的疾病的描述，相差不大。这与魏朝和晋朝之后的医药专家以严谨的态度看待被神化的芝草有关。其中这6种灵芝的药效在现代医学验证下也已经得到了很明确的验证。因此，所载六芝的药效被古今药物学家不断地验证，《神农本草经》中的六芝与现代医学中的灵芝很相近。
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发菌以“井”字形堆叠，高约1m，底部用石块或废木垫空，要求堆内温度控制在20兀以上、28兀以下，晴天中午气温高时应撑膜通风降温。每周将段木上下、内外翻动1次，促进发菌均匀。约经30d，接种穴和树皮下长满菌丝，发菌结束。埋土养菌及子实体发生选排水良好、有水源或树荫下作菌床，畦床宽1.2m，深20cm。将段木横向排放在菌床内，段木间距5cm，以无杂质的细壤土填没段木间隙，而后上面覆2cm的土层。搭荫棚离菌床高60cm，棚上盖稀草帘，外覆薄膜，防止直射光和大雨冲刷。这段时间，减少水分供给，养菌约30d。当段木两端断面上具有黄白色菌丝即进入子实体发生阶段，增加空间的湿度，晴天喷水1~2次，保持土壤湿润。7月初子实体陆续发生。第2年5~7月盛产，第3年仍有子实体产生。
塑料袋质量差塑料袋太薄（0.035mm以下），质量差,段木块毛刺多，装袋、接种及运输过程中未轻拿轻放或机械破损，致使菌袋出现微孔，造成污染。 罩膜初鼓起时，未放冷气；袋破或底层袋泡水或扎口太松造成水袋；常压灭菌保持时间不够、温度不够或中间加水降至100弋以下时间太长；罩膜漏气，温度达不到要求值。接种时料温太高接种时料袋温度太高，超过菌种所能承受的温度范围，造成菌种被烫伤或烫死后不萌发并感染杂菌。培菌环境不良主要是培养室内湿度过大，通风不良，环境不洁，甚至有鼠害。个别芝农在培养室内洒水并使地面上存有积水，空气相对湿度超过70％，利于杂菌滋生。
灭菌彻底灭菌仓内叠放料袋时要堆叠合理，纵向每4排料袋约宽60cm作为一行，行与行之间要留有空隙，以使蒸汽均匀循环。用旺火烧到罩膜鼓起时，排出冷空气，当罩膜内温度达到100P时，连续保持24~30h，才可以停火降温;注意加温过程中要适时加水，保持水在规定的水位范围内，加水过程中要保证罩膜内温度不下降。灭菌时，防止灭菌罩膜漏气，要注意蒸汽炉的蒸汽发生量与灭菌物数量相匹配，灭菌袋数增加，应相应延长灭菌时间。接种时防止料温太高料温太高，超过38t，易烧死菌种，好是在灭菌后的料袋还有余温（32~35t）时接种。提供适宜的培菌环境在培养室或塑料薄膜大棚内暗光培养，好保持七分阴三分阳，以利菌丝生长。鼠害。发菌阶段，要定期检查、翻堆、通风，严防料温上升到32t以上而出现“烧菌”现象；发菌期间培养室（棚）内温度低于20t,可用火加温，每天中午通风1~2h。菌丝爬满木段后，再在弱光环境中培养20d以上，促使菌丝老化，培菌时间需2~3个
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